Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cngb1E1AZ71 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cngb1E1AZ71 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cngb1E1AZ71 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cngb1E1AZ71 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cngb1E1AZ71 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cngb1E1AZ71 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cngb1E1AZ71 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cngb1E1AZ71 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cngb1E1AZ71 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cngb1E1AZ71 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cngb1E1AZ71 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cngb1E1AZ71 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cngb1E1AZ71 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cngb1E1AZ71 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cngb1E1AZ71 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms