Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Ccdc6D3YZP9 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc6D3YZP9 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
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