Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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