Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uhrf1bp1B2KF50 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms