Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NhsB1AV60 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms