Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Trabd2bB1ATG9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Trabd2bB1ATG9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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