Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms