Protein–RNA interactions for Protein: A7KBS4

Zscan4d, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4dA7KBS4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4dA7KBS4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms