Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms