Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms