Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SktA2AQ25 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms