Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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