Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AI481877A2ALV5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AI481877A2ALV5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AI481877A2ALV5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AI481877A2ALV5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AI481877A2ALV5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AI481877A2ALV5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms