Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd1A2AKB4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms