Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms