Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PtprfA2A8L5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PtprfA2A8L5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprfA2A8L5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprfA2A8L5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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