Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms