Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms