Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms