Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pacsin2Q9WVE8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin2Q9WVE8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms