Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme3Q9WV85 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme3Q9WV85 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme3Q9WV85 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme3Q9WV85 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms