Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ArcQ9WV31 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ArcQ9WV31 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ArcQ9WV31 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ArcQ9WV31 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ArcQ9WV31 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ArcQ9WV31 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ArcQ9WV31 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ArcQ9WV31 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ArcQ9WV31 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms