Protein–RNA interactions for Protein: Q9R210

Tfeb, Transcription factor EB, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfebQ9R210 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TfebQ9R210 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms