Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfwd2Q9R1A8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms