Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NrkQ9R0G8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms