Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms