Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms