Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cabp1Q9JLK7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms