Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms