Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrac1Q9JKP8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms