Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms