Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dap3Q9ER88 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms