Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms