Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn1Q9EPL2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms