Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms