Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmg20aQ9DC33 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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