Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms