Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smco2Q9DA21 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms