Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms