Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Rab11fip1Q9D620 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Rab11fip1Q9D620 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rab11fip1Q9D620 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rab11fip1Q9D620 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rab11fip1Q9D620 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rab11fip1Q9D620 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rab11fip1Q9D620 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rab11fip1Q9D620 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rab11fip1Q9D620 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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