Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D454 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D454 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D454 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms