Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Cdh23-204ENSMUST00000105463 10991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Cemip-201ENSMUST00000064174 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms