Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx29Q9D3S3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms