Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D1F3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms