Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms