Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Susd3Q9D176 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Susd3Q9D176 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Susd3Q9D176 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Susd3Q9D176 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Susd3Q9D176 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Susd3Q9D176 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Susd3Q9D176 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Susd3Q9D176 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Susd3Q9D176 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Susd3Q9D176 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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