Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Zbed3Q9D0L1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Zbed3Q9D0L1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Zbed3Q9D0L1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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