Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ChtopQ9CY57 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms