Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Xrcc3Q9CXE6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Xrcc3Q9CXE6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Xrcc3Q9CXE6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Xrcc3Q9CXE6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Xrcc3Q9CXE6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Xrcc3Q9CXE6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Xrcc3Q9CXE6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Xrcc3Q9CXE6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Xrcc3Q9CXE6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Xrcc3Q9CXE6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Xrcc3Q9CXE6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Xrcc3Q9CXE6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Xrcc3Q9CXE6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms