Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms